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Resumen
Predecir computacionalmente la estructura tridimensional de la proteína DKFZp434P0714 de homo sapiens e inferir las regiones funcionales asociadas importantes para la enfermedad del Alzheimer. Se realizó un análisis computacional de la estructura primaria de DKFZp434P0714 a partir de los servidores BLAST, PROTPARAM, PROTSCALE, TMHMM2 y PROSITE. La estructura secundaria se obtuvo por PSIPRED. La predicción de la estructura terciaria de la proteína se realizó mediante el programa Phyre2. El modelo final de la estructura terciaria fue visualizado y editado con el programa PyMol v.0.98. Se validó la estructura terciaria mediante el programa RAMPAGE. La predicción de sitios activos se realizó mediante el servidor Q-sitefinder. Por último, se realizó una modelamiento con la proteína homologa del BlAST armadillo repeatcontaining 2, isoformCRA_b [Homo sapiens] con el programa CLUSPRO 2.0. Se propone un modelo computacional, se demuestra la existencia de patrones que podrían tener un papel importante en el Alzheimer; se encontró el dominio (ARM). Tambien un dominio receptor LDL-receptor class A, con un receptor neuronal LRP1 unido a APP, afectando el tráfico celular que induce el desarrollo del Alzheimer. La transcripción Tcf/LEF-1 mediado por β–catenina presente en ARM, está involucrada en la determinación del destino de células progenitoras gliales en la neocorteza humana, estas con fenotipo antígeno NG2+ predominan en cerebros lesionados como en el Alzheimer. La coincidencia entre segmentos estructurales y funcionales sugiere que el modelo puede usarse para predecir ciertos aspectos del comportamiento biológico de la proteína en cuanto a los mecanismos de activación de la enfermedad de Alzheimer.